Trên vùng đất siêu việt của Gamindustri, một thảm họa đe dọa tan rã mọi giấc mơ. Các CPU đã chiến đấu dũng cảm nhưng vẫn không thể ngăn chặn sự hủy diệt từ một thế lực bí ẩn. Neptunia, cô nàng CPU năng động và hài hước, phải đối mặt với thử thách lớn nhất trong sự nghiệp của mình. Cô quyết định tìm kiếm sức mạnh mới, được truyền cảm hứng bởi tình đồng đội với cả Uzume, một CPU khác từ một chiều không gian xa xôi.
Trên hành trình phiêu lưu nguy hiểm, Neptunia và Uzume phải đối mặt với các thử thách khó khăn và cuộc gặp gỡ với những nhân vật đầy bí ẩn. Họ nhận ra rằng để chiến thắng, họ cần phải vượt qua những sợ hãi và lẽ phải chịu đựng những thất bại.
Trong một ngày đen tối, khi mọi hy vọng dường như đã mất, Neptunia và Uzume phát hiện ra bí mật đau lòng về thế lực đang đe dọa thế giới của họ. Liệu họ có đủ sức mạnh và can đảm để vực dậy Gamindustri khỏi bờ vực của sự hủy diệt hay không? Chỉ có thời gian mới có thể trả lời...